Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms