Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCO2Q9BYV7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCO2Q9BYV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCO2Q9BYV7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCO2Q9BYV7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCO2Q9BYV7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCO2Q9BYV7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms