Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms