Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms