Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB11FIP5Q9BXF6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11FIP5Q9BXF6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms