Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VN1R3Q9BXE9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R3Q9BXE9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms