Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms