Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms