Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TINF2Q9BSI4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms