Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UTP23Q9BRU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UTP23Q9BRU9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms