Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBF4Q9BQW3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms