Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPAT1Q99943 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGPAT1Q99943 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPAT1Q99943 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms