Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms