Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHOX2BQ99453 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms