Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG8Q96MW5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms