Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms