Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q96MF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q96MF0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q96MF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q96MF0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q96MF0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q96MF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q96MF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q96MF0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms