Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf85Q96MD7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms