Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms