Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC7Q96M83 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CCDC7Q96M83 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms