Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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