Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EAF1Q96JC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EAF1Q96JC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms