Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG3Q96JB2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG3Q96JB2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms