Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNF8Q96H20 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNF8Q96H20 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms