Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APIPQ96GX9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms