Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC4Q96FT7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms