Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms