Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MTERF3Q96E29 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms