Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39BQ96DA2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB39BQ96DA2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms