Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCN3Q96D15 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms