Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUNDC1Q96C34 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms