Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RFT1Q96AA3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFT1Q96AA3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms