Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms