Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TRIM63Q969Q1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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