Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms