Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C6Q969F1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms