Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR2Q969E8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR2Q969E8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms