Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms