Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX13Q92968 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX13Q92968 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEX13Q92968 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX13Q92968 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX13Q92968 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX13Q92968 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX13Q92968 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX13Q92968 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX13Q92968 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX13Q92968 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX13Q92968 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms