Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDAQ92838 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDAQ92838 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDAQ92838 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDAQ92838 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDAQ92838 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDAQ92838 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDAQ92838 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms