Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCSTNQ92542 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCSTNQ92542 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCSTNQ92542 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms