Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTSF1Q8WW33 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTSF1Q8WW33 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms