Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKA2Q8WVK7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKA2Q8WVK7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms