Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TRIM41Q8WV44 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms