Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1BQ8WUY9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 625.8 ms