Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms