Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RB1CC1Q8TDY2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
RB1CC1Q8TDY2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
RB1CC1Q8TDY2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms