Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAT3Q8TDW7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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