Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP4Q8TDF6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP4Q8TDF6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms