Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms